De figuur laat de verdeling van de baten en lasten zien van NWO, KNAW en KB.
| Overige baten | Baten van derden | Overige overheidsbijdragen | Rijksbijdragen OCW | |
|---|---|---|---|---|
| 2006 | 25,3 | 32,6 | 85,5 | 534 |
| 2007 | 25,5 | 36,6 | 90,8 | 599,3 |
| 2008 | 25,9 | 34,9 | 91,6 | 642 |
| 2009 | 24,7 | 41,5 | 87,5 | 753,1 |
| 2010 | 18,9 | 45,6 | 100,1 | 764,9 |
| 2011 | 32,2 | 52,4 | 100,2 | 727,3 |
| 2012 | 19,8 | 46,3 | 113,9 | 755,9 |
| 2013 | 27,1 | 48 | 101,8 | 757,7 |
| 2014 | 30,1 | 43,5 | 122,3 | 826,3 |
| 2015 | 22,9 | 39,8 | 140,2 | 884,7 |
| 2016 | 26,6 | 36,8 | 136,9 | 947,7 |
| 2017 | 28,9 | 40,0 | 152,0 | 927,0 |
De baten van de drie instellingen bestaan voor het grootste deel (ongeveer 80%) uit de Rijksbijdrage. De baten van derden en overige baten maken slechts een klein deel uit van de totale baten, met een gezamenlijke omvang van 6% in 2017.
| Overige lasten | Huisvestingslasten | Afschrijvingen | Personele lasten | |
|---|---|---|---|---|
| 2006 | 435,7 | 28,9 | 12 | 215,9 |
| 2007 | 453,6 | 30,7 | 10,7 | 213,9 |
| 2008 | 446,8 | 28,9 | 10,1 | 214,5 |
| 2009 | 531,9 | 30,1 | 9 | 276,8 |
| 2010 | 664,9 | 31,1 | 9,5 | 235,4 |
| 2011 | 682,3 | 32,1 | 10,3 | 242,3 |
| 2012 | 625,6 | 40,5 | 22,6 | 269,8 |
| 2013 | 1221 | 39 | 21,4 | 273,3 |
| 2014 | 632,8 | 36,9 | 21,6 | 268,9 |
| 2015 | 736 | 34,4 | 22,4 | 294,9 |
| 2016 | 689,3 | 37,4 | 21,8 | 297,7 |
| 2017 | 744,6 | 33,6 | 28,0 | 306,6 |
De categorie "overige lasten" neemt het grootste deel binnen de totale lasten voor zijn rekening met een aandeel van ongeveer tweederde. In 2013 neemt dit aandeel incidenteel toe tot bijna 80% en daalt daarna weer tot tweederde. Deze overige lasten bestaan grotendeels uit de onderzoekssubsidies die NWO verstrekt aan derden. Het aandeel van de personele lasten is ongeveer 30%.